自然館入口ではナウマン象の全身骨格模型がみなさまをお迎えし、三浦半島でみられる動植物や昆虫、魚類などの標本や生態写真、地形などを展示しています。珍しい標本コーナーや森林のジオラマもあります。人文館では、「三浦半島にヒトが住みついたころ」から近現代までの幅広い歴史を、土器や埴輪、漁撈用具、近代の幕開けでもあるペリー来航の史料や横須賀製鉄所の模型などで展示しています。その他にも、年３回の特別展・企画展、博物館教室や野外行事も開催しております。